Đảng ủy Ủy ban nhân dân tỉnh Khánh Hòa là đơn vị trực thuộc Tỉnh ủy được thành lập theo Quyết định số 02-QĐ/TU, ngày 01/7/2025 của Tỉnh ủy Khánh Hòa. Đảng ủy hiện có 04 cơ quan tham mưu, giúp việc gồm: Ban Tuyên giáo và Dân vận, Ban Tổ chức, Ủy ban Kiểm tra, Văn phòng.

Đảng ủy Ủy ban nhân dân tỉnh có 63 tổ chức cơ sở đảng trực thuộc gồm các Sở, Ban, Ngành, các cơ quan, đơn vị, trường học, bệnh viện trực thuộc Ủy ban nhân dân tỉnh; các cơ quan Trung ương đóng chân trên ddijaj bàn tỉnh và các doanh nghiệp Nhà nước với hơn 10 ngàn đảng viên.